根据教育部公布的高校名单可知：昌吉公办本科大学有昌吉学院、新疆农业职业技术大学等学校，共计2所。以下是昌吉所有公办本科大学名单一览表，排名不分先后，希望对大家有所帮助。

序号    学校名称    省份    城市    层次    备注
1    昌吉学院    新疆    昌吉    本科    公办
2    新疆农业职业技术大学    新疆    昌吉    本科    公办
昌吉学院简介

昌吉学院（ChangJi College），位于新疆维吾尔自治区昌吉市，由新疆维吾尔自治区人民政府举办、教育部批准的省属普通高等学校。是首批国家语言文字推广基地、新疆维吾尔自治区语言文字工作示范校、铸牢中华民族共同体意识研究与实践基地培育单位、新疆维吾尔自治区科普教育基地、新疆低阶煤高值化绿色利用自治区重点实验室、新疆维吾尔自治区通用技术实验教学示范中心、新疆基础教育质量提升研究中心、教育部“特需项目”建设单位。

学校前身是始建于1959年的昌吉师范学校。1985年升格为昌吉师范专科学校。2001年5月更名为昌吉学院。