合肥职业技术学院有医学院、汽车工程学院、机电工程学院、轨道交通学院、生物工程学院、信息工程与传媒学院、经贸旅游学院、建筑工程学院、基础教育学院、马克思主义学院等学院，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

1、院系设置
医学院

汽车工程学院

机电工程学院

轨道交通学院

生物工程学院

信息工程与传媒学院

经贸旅游学院

建筑工程学院

基础教育学院

电大（继续教育学院）

马克思主义学院

2、合肥职业技术学院简介
合肥职业技术学院是合肥市属综合性高职院校，是省教育厅确立的安徽省首批16所地方技能型高水平大学之一，是国家“创新发展行动计划”优质专科高等职业院校建设单位。
2002年，由原巢湖卫生学校、巢湖农业学校（安徽省土地管理学校）、巢湖财政学校合并升格为巢湖职业技术学院。随后，安徽省汽车运输高级技工学校、安徽广播电视大学巢湖分校和巢湖商业干部学校先后并入。2012年4月，教育部批准巢湖职业技术学院更名为合肥职业技术学院。